MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d

Total Repeats: 4537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018294	GC	3	6	224	229	0 %	0 %	50 %	50 %	399995010
2	NC_018294	TCG	2	6	231	236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995010
3	NC_018294	CCA	2	6	239	244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995010
4	NC_018294	CG	3	6	262	267	0 %	0 %	50 %	50 %	399995010
5	NC_018294	GCG	2	6	294	299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995010
6	NC_018294	GCGG	2	8	351	358	0 %	0 %	75 %	25 %	399995010
7	NC_018294	GTC	2	6	404	409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995010
8	NC_018294	GCC	2	6	462	467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995010
9	NC_018294	GAC	2	6	472	477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995010
10	NC_018294	CGA	2	6	507	512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995010
11	NC_018294	GCC	2	6	556	561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995010
12	NC_018294	CG	3	6	594	599	0 %	0 %	50 %	50 %	399995010
13	NC_018294	GCA	2	6	609	614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995010
14	NC_018294	GCC	2	6	673	678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995010
15	NC_018294	CCG	2	6	706	711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995010
16	NC_018294	ATC	2	6	769	774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995010
17	NC_018294	CAA	2	6	778	783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995010
18	NC_018294	GC	3	6	908	913	0 %	0 %	50 %	50 %	399995011
19	NC_018294	GGC	2	6	931	936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995011
20	NC_018294	CGGC	2	8	969	976	0 %	0 %	50 %	50 %	399995011
21	NC_018294	GGC	2	6	1072	1077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995011
22	NC_018294	AAC	2	6	1079	1084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995011
23	NC_018294	CTT	2	6	1135	1140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995011
24	NC_018294	TCG	2	6	1190	1195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995011
25	NC_018294	CGG	2	6	1219	1224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995011
26	NC_018294	CGA	2	6	1260	1265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995011
27	NC_018294	GCG	2	6	1333	1338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995011
28	NC_018294	GCC	2	6	1367	1372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995011
29	NC_018294	CGT	2	6	1393	1398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995011
30	NC_018294	CGG	2	6	1405	1410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995011
31	NC_018294	CCA	2	6	1428	1433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995011
32	NC_018294	GCG	2	6	1458	1463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995011
33	NC_018294	CAG	2	6	1603	1608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995011
34	NC_018294	GAT	2	6	1609	1614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995011
35	NC_018294	GC	3	6	1619	1624	0 %	0 %	50 %	50 %	399995011
36	NC_018294	GCG	2	6	1638	1643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995011
37	NC_018294	TGA	2	6	1656	1661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995011
38	NC_018294	TCGG	2	8	1682	1689	0 %	25 %	50 %	25 %	399995011
39	NC_018294	TCA	2	6	2039	2044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995012
40	NC_018294	TG	3	6	2063	2068	0 %	50 %	50 %	0 %	399995012
41	NC_018294	GC	3	6	2081	2086	0 %	0 %	50 %	50 %	399995012
42	NC_018294	CCG	2	6	2321	2326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995013
43	NC_018294	CAT	2	6	2385	2390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995013
44	NC_018294	GA	3	6	2446	2451	50 %	0 %	50 %	0 %	399995013
45	NC_018294	GGC	2	6	2454	2459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995013
46	NC_018294	GC	3	6	2546	2551	0 %	0 %	50 %	50 %	399995013
47	NC_018294	ATC	2	6	2605	2610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995013
48	NC_018294	TCC	2	6	2710	2715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995013
49	NC_018294	TCA	2	6	2726	2731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995013
50	NC_018294	GCG	2	6	2760	2765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995013
51	NC_018294	GCA	2	6	2819	2824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995013
52	NC_018294	TCG	2	6	2884	2889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995013
53	NC_018294	TTG	2	6	2902	2907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995013
54	NC_018294	TTC	2	6	2920	2925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995013
55	NC_018294	TGA	2	6	2948	2953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995013
56	NC_018294	TGC	2	6	2969	2974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995013
57	NC_018294	GTT	2	6	2979	2984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995013
58	NC_018294	CCA	2	6	2988	2993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995013
59	NC_018294	CGAG	2	8	3042	3049	25 %	0 %	50 %	25 %	399995013
60	NC_018294	TCG	2	6	3128	3133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995013
61	NC_018294	ACG	3	9	3241	3249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995013
62	NC_018294	GCG	2	6	3265	3270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995013
63	NC_018294	CCT	2	6	3281	3286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995013
64	NC_018294	GA	3	6	3337	3342	50 %	0 %	50 %	0 %	399995013
65	NC_018294	CCG	2	6	3353	3358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995013
66	NC_018294	CGGCC	2	10	3366	3375	0 %	0 %	40 %	60 %	399995013
67	NC_018294	CGC	2	6	3452	3457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995013
68	NC_018294	CGG	2	6	3494	3499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995013
69	NC_018294	A	6	6	3508	3513	100 %	0 %	0 %	0 %	399995013
70	NC_018294	CGA	2	6	3514	3519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995013
71	NC_018294	GCC	2	6	3588	3593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995013
72	NC_018294	CAG	2	6	3597	3602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995013
73	NC_018294	GTG	2	6	3622	3627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995013
74	NC_018294	CGG	2	6	3629	3634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995013
75	NC_018294	ATC	2	6	3643	3648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995013
76	NC_018294	GCC	2	6	3694	3699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995013
77	NC_018294	CAG	2	6	3711	3716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995013
78	NC_018294	GGT	2	6	3771	3776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995013
79	NC_018294	ACC	2	6	3832	3837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995013
80	NC_018294	TTG	2	6	3856	3861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995013
81	NC_018294	CAG	2	6	3870	3875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995013
82	NC_018294	CCGG	2	8	3917	3924	0 %	0 %	50 %	50 %	399995013
83	NC_018294	TG	3	6	4240	4245	0 %	50 %	50 %	0 %	399995014
84	NC_018294	CGT	2	6	4254	4259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995014
85	NC_018294	CGT	2	6	4295	4300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995014
86	NC_018294	CGC	2	6	4338	4343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995014
87	NC_018294	AGG	2	6	4358	4363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995014
88	NC_018294	GC	3	6	4440	4445	0 %	0 %	50 %	50 %	399995014
89	NC_018294	GTC	2	6	4575	4580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995015
90	NC_018294	CTG	2	6	4607	4612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995015
91	NC_018294	TCA	2	6	4615	4620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995015
92	NC_018294	CTG	2	6	4629	4634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995015
93	NC_018294	TGC	2	6	4670	4675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995015
94	NC_018294	TCG	2	6	4711	4716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995015
95	NC_018294	GC	3	6	4728	4733	0 %	0 %	50 %	50 %	399995015
96	NC_018294	TTCG	2	8	4743	4750	0 %	50 %	25 %	25 %	399995015
97	NC_018294	GCAG	2	8	4791	4798	25 %	0 %	50 %	25 %	399995015
98	NC_018294	CGC	2	6	4826	4831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995015
99	NC_018294	TGA	2	6	4840	4845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995015
100	NC_018294	CTG	2	6	4848	4853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995015
101	NC_018294	GGC	2	6	4865	4870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995015
102	NC_018294	GGCT	2	8	4884	4891	0 %	25 %	50 %	25 %	399995015
103	NC_018294	GAC	2	6	4892	4897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995015
104	NC_018294	CAA	2	6	4916	4921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995015
105	NC_018294	TGA	2	6	4960	4965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995015
106	NC_018294	CGG	3	9	4987	4995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995015
107	NC_018294	AAG	2	6	5052	5057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995015
108	NC_018294	CTG	2	6	5084	5089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995016
109	NC_018294	TCG	2	6	5091	5096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995016
110	NC_018294	TTG	2	6	5121	5126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995016
111	NC_018294	GGC	2	6	5151	5156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995016
112	NC_018294	GGC	2	6	5188	5193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995016
113	NC_018294	CGG	2	6	5197	5202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995016
114	NC_018294	TCT	2	6	5260	5265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995016
115	NC_018294	GCA	3	9	5278	5286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995016
116	NC_018294	CCGC	2	8	5313	5320	0 %	0 %	25 %	75 %	399995016
117	NC_018294	CGA	2	6	5329	5334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995016
118	NC_018294	CCA	2	6	5386	5391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995016
119	NC_018294	TCG	2	6	5517	5522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995016
120	NC_018294	CG	3	6	5532	5537	0 %	0 %	50 %	50 %	399995016
121	NC_018294	CGCT	2	8	5540	5547	0 %	25 %	25 %	50 %	399995016
122	NC_018294	CGT	2	6	5578	5583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995016
123	NC_018294	CTG	2	6	5732	5737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995016
124	NC_018294	GCC	2	6	5741	5746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995016
125	NC_018294	CG	3	6	6027	6032	0 %	0 %	50 %	50 %	399995017
126	NC_018294	GC	3	6	6043	6048	0 %	0 %	50 %	50 %	399995017
127	NC_018294	GATG	2	8	6093	6100	25 %	25 %	50 %	0 %	399995017
128	NC_018294	CG	3	6	6111	6116	0 %	0 %	50 %	50 %	399995017
129	NC_018294	GCC	2	6	6151	6156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995017
130	NC_018294	GACA	2	8	6172	6179	50 %	0 %	25 %	25 %	399995017
131	NC_018294	GC	3	6	6190	6195	0 %	0 %	50 %	50 %	399995017
132	NC_018294	TGC	2	6	6201	6206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995017
133	NC_018294	GAC	2	6	6578	6583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995018
134	NC_018294	GCCG	2	8	6587	6594	0 %	0 %	50 %	50 %	399995018
135	NC_018294	TCA	2	6	6619	6624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995018
136	NC_018294	CTT	2	6	6697	6702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995018
137	NC_018294	ACCT	2	8	6728	6735	25 %	25 %	0 %	50 %	399995018
138	NC_018294	ACGGAT	2	12	6834	6845	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	399995018
139	NC_018294	AAT	2	6	6852	6857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	399995018
140	NC_018294	T	6	6	6884	6889	0 %	100 %	0 %	0 %	399995018
141	NC_018294	CTT	2	6	6899	6904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995018
142	NC_018294	T	6	6	6919	6924	0 %	100 %	0 %	0 %	399995018
143	NC_018294	ATCA	2	8	7040	7047	50 %	25 %	0 %	25 %	399995018
144	NC_018294	GATC	2	8	7690	7697	25 %	25 %	25 %	25 %	399995020
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148	NC_018294	CGTC	2	8	7894	7901	0 %	25 %	25 %	50 %	399995020
149	NC_018294	GGC	2	6	7912	7917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995020
150	NC_018294	GGT	2	6	7944	7949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995020
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152	NC_018294	CGC	2	6	8030	8035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995020
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154	NC_018294	TTC	2	6	8118	8123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995021
155	NC_018294	CCA	2	6	8150	8155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995021
156	NC_018294	TCA	2	6	8159	8164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995021
157	NC_018294	GCC	2	6	8431	8436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995021
158	NC_018294	GCC	2	6	8443	8448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995021
159	NC_018294	GAC	2	6	8550	8555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995021
160	NC_018294	CGT	2	6	8570	8575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995021
161	NC_018294	GAG	2	6	8580	8585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995021
162	NC_018294	GTC	2	6	8596	8601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995021
163	NC_018294	TGCCG	2	10	8602	8611	0 %	20 %	40 %	40 %	399995021
164	NC_018294	CAGG	2	8	8633	8640	25 %	0 %	50 %	25 %	399995021
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168	NC_018294	ATGG	2	8	8843	8850	25 %	25 %	50 %	0 %	399995022
169	NC_018294	CGT	2	6	8904	8909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995022
170	NC_018294	ATT	2	6	8939	8944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	399995022
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174	NC_018294	CGG	2	6	9096	9101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995022
175	NC_018294	CTT	2	6	9161	9166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995022
176	NC_018294	CCA	2	6	9178	9183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995022
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182	NC_018294	GGC	2	6	9765	9770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995023
183	NC_018294	GTTCG	2	10	9771	9780	0 %	40 %	40 %	20 %	399995023
184	NC_018294	ATGG	2	8	9799	9806	25 %	25 %	50 %	0 %	399995023
185	NC_018294	ACG	2	6	9818	9823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995023
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189	NC_018294	CGA	3	9	9997	10005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995024
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199	NC_018294	GC	3	6	10586	10591	0 %	0 %	50 %	50 %	399995025
200	NC_018294	TAA	2	6	10742	10747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	399995025
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260	NC_018294	TCT	2	6	14459	14464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995031
261	NC_018294	GAT	2	6	14550	14555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995031
262	NC_018294	CGC	2	6	14556	14561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995031
263	NC_018294	GCCG	2	8	14630	14637	0 %	0 %	50 %	50 %	399995031
264	NC_018294	CG	3	6	14678	14683	0 %	0 %	50 %	50 %	399995031
265	NC_018294	ATG	2	6	14704	14709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995031
266	NC_018294	GCT	2	6	14753	14758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995031
267	NC_018294	ATC	2	6	14817	14822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995031
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270	NC_018294	CGG	2	6	15401	15406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995032
271	NC_018294	TGC	2	6	15466	15471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995032
272	NC_018294	GC	3	6	15480	15485	0 %	0 %	50 %	50 %	399995032
273	NC_018294	CGG	2	6	15518	15523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995032
274	NC_018294	TCG	2	6	15568	15573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995032
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280	NC_018294	CG	3	6	15813	15818	0 %	0 %	50 %	50 %	399995032
281	NC_018294	TGG	2	6	15836	15841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995032
282	NC_018294	CGA	2	6	15844	15849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995032
283	NC_018294	GC	3	6	15851	15856	0 %	0 %	50 %	50 %	399995032
284	NC_018294	GCA	3	9	16021	16029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995033
285	NC_018294	ACA	2	6	16128	16133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995033
286	NC_018294	GCC	2	6	16150	16155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995033
287	NC_018294	ACG	2	6	16239	16244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995033
288	NC_018294	TCG	2	6	16248	16253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995033
289	NC_018294	TGC	2	6	16259	16264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995033
290	NC_018294	TCG	2	6	16281	16286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995033
291	NC_018294	GCGG	2	8	16512	16519	0 %	0 %	75 %	25 %	399995034
292	NC_018294	CAG	2	6	16533	16538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995034
293	NC_018294	CAGC	2	8	16577	16584	25 %	0 %	25 %	50 %	399995034
294	NC_018294	CAG	2	6	16652	16657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995034
295	NC_018294	CTCGAT	2	12	16658	16669	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	399995034
296	NC_018294	T	7	7	16669	16675	0 %	100 %	0 %	0 %	399995034
297	NC_018294	AGC	2	6	16715	16720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995034
298	NC_018294	CG	3	6	16825	16830	0 %	0 %	50 %	50 %	399995035
299	NC_018294	TTA	2	6	16833	16838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	399995035
300	NC_018294	CTGG	2	8	16845	16852	0 %	25 %	50 %	25 %	399995035
301	NC_018294	TCG	2	6	16863	16868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995035
302	NC_018294	CCG	2	6	16932	16937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995035
303	NC_018294	CAT	2	6	16995	17000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995035
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332	NC_018294	CCG	2	6	18714	18719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995037
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